81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2141 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2141  putative thiamine transport system permease protein  100 
 
 		 479 aa  922    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0215  putative thiamine transport system permease protein  59.92 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1959  putative thiamine transport system permease protein  59.5 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00333763  hitchhiker  0.0000000000000171313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1088  putative thiamine transport system permease protein  62.37 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0609766  normal  0.0363545 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.81 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 		 532 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 		 606 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.32 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.73 
 
 		 592 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.87 
 
 		 585 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 		 311 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 		 510 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 		 586 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  21.1 
 
 		 583 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  33.06 
 
 		 685 aa  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 		 296 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.291205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 		 568 aa  50.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 		 269 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.8 
 
 		 663 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.6 
 
 		 569 aa  49.3  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 		 272 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00609739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.11 
 
 		 225 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  26.13 
 
 		 514 aa  47.8  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.06 
 
 		 700 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 		 560 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  29.19 
 
 		 536 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  30.16 
 
 		 535 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 		 544 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  28.36 
 
 		 516 aa  47  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.39 
 
 		 634 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 264 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 264 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0119  ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 		 284 aa  47  0.0008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.232154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  30 
 
 		 536 aa  47  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  29.03 
 
 		 535 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  29.57 
 
 		 543 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  30 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  28.71 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  28.71 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  28.71 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  28.71 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  30 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  28.23 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  26.84 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  27.9 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 		 264 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  30 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  29.52 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  28.71 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  30 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.75 
 
 		 547 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  29.36 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  25.49 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.32 
 
 		 545 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 		 692 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.24 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  20.59 
 
 		 545 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  28.71 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  28.71 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  20.36 
 
 		 552 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 		 286 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.66 
 
 		 574 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 		 264 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 		 265 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 		 597 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6500  ABC transporter permease  30 
 
 		 264 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.32 
 
 		 226 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  26.51 
 
 		 291 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 		 692 aa  43.5  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  20.41 
 
 		 585 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  20.41 
 
 		 583 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5612  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  27.96 
 
 		 296 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>