57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0215 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0215  putative thiamine transport system permease protein  100 
 
 		 474 aa  903    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1959  putative thiamine transport system permease protein  62.42 
 
 		 479 aa  567  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00333763  hitchhiker  0.0000000000000171313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2141  putative thiamine transport system permease protein  59.92 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1088  putative thiamine transport system permease protein  61.56 
 
 		 471 aa  463  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0609766  normal  0.0363545 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  34.75 
 
 		 685 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.24 
 
 		 692 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.97 
 
 		 692 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.33 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.32 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 700 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.54 
 
 		 547 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.05 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.97 
 
 		 569 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 		 728 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 		 568 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 		 336 aa  50.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 		 692 aa  50.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.45 
 
 		 574 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 		 692 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.28 
 
 		 574 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 		 574 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.41 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.79 
 
 		 585 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 585 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 585 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.64 
 
 		 574 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  26.39 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.2 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.63 
 
 		 232 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  25.48 
 
 		 583 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  25.16 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  25.16 
 
 		 583 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  25.16 
 
 		 585 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 		 274 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.301683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  33.33 
 
 		 516 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 		 281 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 		 743 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 		 263 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 		 330 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 		 318 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.15 
 
 		 561 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  25.16 
 
 		 583 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.16 
 
 		 545 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 		 742 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  30.77 
 
 		 530 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  27.74 
 
 		 279 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0308  ABC transporter, permease protein, putative  35.71 
 
 		 296 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.53 
 
 		 585 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 		 311 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 		 318 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  34.07 
 
 		 516 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 		 611 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>