43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1959 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1959  putative thiamine transport system permease protein  100 
 
 		 479 aa  921    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00333763  hitchhiker  0.0000000000000171313 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0215  putative thiamine transport system permease protein  62.42 
 
 		 474 aa  566  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1088  putative thiamine transport system permease protein  73.46 
 
 		 471 aa  551  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0609766  normal  0.0363545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2141  putative thiamine transport system permease protein  59.5 
 
 		 479 aa  524  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.13 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.77 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 		 692 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 		 692 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 		 692 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  34.4 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 		 597 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 		 606 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 		 568 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  24.68 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.23 
 
 		 574 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.33 
 
 		 232 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.48 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 		 634 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.86 
 
 		 569 aa  49.3  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  28.44 
 
 		 534 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  33.82 
 
 		 542 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 		 663 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 		 563 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 		 700 aa  47  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  28.42 
 
 		 516 aa  47  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.75 
 
 		 585 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.56 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 		 692 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  26.44 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.69 
 
 		 225 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.22 
 
 		 574 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 		 585 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.05 
 
 		 312 aa  43.9  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  24.75 
 
 		 552 aa  43.5  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 		 274 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.301683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>