52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0669 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0669  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
348 aa  684    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1612  FAD dependent oxidoreductase  73.76 
 
 
342 aa  525  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0637  FAD dependent oxidoreductase  72.42 
 
 
342 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0537  FAD dependent oxidoreductase  68.53 
 
 
339 aa  472  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0497  FAD dependent oxidoreductase  51.78 
 
 
351 aa  338  9.999999999999999e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.317622  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1006  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0540  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
326 aa  94  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
492 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
413 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
496 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
500 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
500 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1292  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
395 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
419 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
819 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03540  cytoplasm protein, putative  27.65 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  19.71 
 
 
441 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
398 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0636  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
433 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188486  normal  0.91294 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  22.33 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.83 
 
 
415 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  28.83 
 
 
415 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
391 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
816 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.83 
 
 
415 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  28.83 
 
 
415 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.83 
 
 
415 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
385 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
830 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
830 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.83 
 
 
415 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
404 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  26.44 
 
 
421 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
388 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
816 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>