287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0541 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0541  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  303  7e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0982669  normal  0.227881 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2201  protein of unknown function DUF59  46.75 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0615037  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2095  hypothetical protein  51.96 
 
 
127 aa  100  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.669364  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  46.09 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0398  hypothetical protein  45.37 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180623 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  46.08 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1665  protein of unknown function DUF59  43.14 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.670958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1951  hypothetical protein  41.18 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655053  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  45.26 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2619  protein of unknown function DUF59  39.25 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.830431  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  44.09 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  40.62 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1319  protein of unknown function DUF59  30.93 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  37.08 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  42.55 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  44 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2608  hypothetical protein  34 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  39.18 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  42.67 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  38.14 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  38.71 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  37.23 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  36.17 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  41.18 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  41.49 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  36.56 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  44.21 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  40.43 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  39.36 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  40.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  41.94 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  35.05 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  40.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  35.48 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  37.63 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  36.36 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4256  hypothetical protein  32.29 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  40.45 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  33.68 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  34.44 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  36.26 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  37.23 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  34.83 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  43.16 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  33.7 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  40.23 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  36.26 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  36.17 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  36.17 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  37.11 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  36.17 
 
 
238 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  36.17 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0899  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  41.38 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  36.59 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  38.04 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  35.87 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  41.84 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3638  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  39.78 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  36.96 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  34.07 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  40.86 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  36.67 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  46.03 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  36.84 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  37 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  39.36 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  35.37 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  34.78 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  37.23 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  35.56 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  32.61 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  37.78 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  37.63 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4286  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  38.04 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.335667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  46.03 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  36.96 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  38.14 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  38.14 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  35 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  33 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  38.95 
 
 
120 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  38.04 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  38.95 
 
 
120 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  32.58 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  32.98 
 
 
112 aa  53.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  32.04 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  31.87 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  32.61 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 
127 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  36.46 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  39.47 
 
 
323 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  35.87 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>