66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1851 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  855    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  53.19 
 
 
417 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  52.05 
 
 
418 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  50.6 
 
 
416 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  51.95 
 
 
415 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  51.8 
 
 
418 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  49.51 
 
 
415 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  37.84 
 
 
420 aa  262  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  33.17 
 
 
398 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  32.45 
 
 
397 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  32.73 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  30.58 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  39.76 
 
 
390 aa  193  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  31.89 
 
 
457 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  31.1 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  30.59 
 
 
457 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  31.44 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  30.46 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  30.6 
 
 
413 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  29.68 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  36.17 
 
 
334 aa  93.6  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  25.67 
 
 
402 aa  90.1  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  33.84 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  24.13 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  26.69 
 
 
403 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  24.57 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  32.98 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  31.46 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  33.52 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.33 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  25.71 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  28 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  28.57 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  28.65 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  32.69 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  30.37 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
224 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  29.08 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  25.71 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  28.27 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  23.33 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.08 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
393 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  26.8 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.92 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.32 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  27.81 
 
 
236 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  21.11 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.11 
 
 
269 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  28.39 
 
 
209 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  24.65 
 
 
230 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  21.64 
 
 
224 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  27.46 
 
 
212 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2448  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.45 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420996  hitchhiker  0.000000146766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4421  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.93 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0508871  normal  0.0915045 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0315  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  29.82 
 
 
261 aa  47.8  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4359  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.93 
 
 
453 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1992  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.2 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1776  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.28 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0312  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.32 
 
 
462 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2605  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.28 
 
 
458 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488351  normal  0.353645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>