38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0019 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0019  plasmid stability protein StbC  100 
 
 		 97 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0380378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3475  plasmid stability protein StbC  71.76 
 
 		 85 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.269317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  68.24 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0468  plasmid stability protein StbC  61.18 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0727  plasmid stability protein StbC  60 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.460533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3768  plasmid stability protein StbC  61.45 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411403  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4189  plasmid stability protein-like protein  56.7 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.848432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  50 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4711  plasmid stability protein-like protein  59.76 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  55.29 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  58.54 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4765  plasmid stabilization protein  52.94 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.218672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3193  putative plasmid stabilization protein  55.42 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  49.41 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  49.41 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4675  hypothetical protein  56.47 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0895  plasmid stability protein-like  56.1 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  53.57 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36410  plasmid stability protein StbC  65.15 
 
 		 71 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.937788  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3570  hypothetical protein  54.12 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2303  plasmid stabilization protein  49.41 
 
 		 84 aa  84.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3028  hypothetical protein  50.59 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2333  plasmid stabilization protein  52.44 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.209572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1215  putative plasmid stability protein StbC  48.78 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3520  putative plasmid stability protein StbC  48.78 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3888  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7720  plasmid stability protein  46.91 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3137  plasmid stabilization protein  47.06 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384782  normal  0.487759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  42.35 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1722  putative stabilization protein  52.94 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  39.53 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  45.45 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  40.32 
 
 		 79 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  38.71 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  52.5 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0760602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>