31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4772 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  40.77 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  33.53 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  31.08 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  35 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  35.42 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1427 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  29 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  25.71 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  27.01 
 
 		 1150 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  27.27 
 
 		 593 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  31.18 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 502 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  31.25 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  31.91 
 
 		 419 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  35.35 
 
 		 389 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1185  hypothetical protein  26.61 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0012154  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  27.73 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  33 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  33.02 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  34.74 
 
 		 684 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  24.84 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1081  hypothetical protein  24.6 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3982  hypothetical protein  28.72 
 
 		 209 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2921  hypothetical protein  25.81 
 
 		 210 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.525203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>