20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1511 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  713    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  34.78 
 
 
342 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  32.85 
 
 
323 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1081  hypothetical protein  29.81 
 
 
397 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1185  hypothetical protein  30.9 
 
 
389 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0012154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  31.11 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0519  hypothetical protein  31.79 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3982  hypothetical protein  27.73 
 
 
209 aa  53.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2921  hypothetical protein  25.21 
 
 
210 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.525203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  29.51 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  36.23 
 
 
593 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  30 
 
 
1150 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0890  hypothetical protein  25.64 
 
 
218 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  26.12 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  38.24 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0784  hypothetical protein  24.39 
 
 
231 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  23.24 
 
 
684 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2601  putative signal transduction protein with NACHT domain  34.25 
 
 
100 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  32.43 
 
 
419 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>