27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0859 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  100 
 
 
593 aa  1214    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0550  hypothetical protein  26.15 
 
 
773 aa  64.3  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000581827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  34.33 
 
 
353 aa  63.9  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  25.5 
 
 
909 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  30.43 
 
 
334 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  30.05 
 
 
362 aa  60.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  32.35 
 
 
334 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  25.23 
 
 
862 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  27.67 
 
 
2216 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  24.61 
 
 
847 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  36.17 
 
 
684 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  29.01 
 
 
397 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  31.31 
 
 
394 aa  54.3  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  27.27 
 
 
346 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.2 
 
 
1427 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0065  hypothetical protein  21.68 
 
 
754 aa  50.4  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000275591  decreased coverage  0.0000022772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  32.26 
 
 
280 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  34.38 
 
 
373 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  31.13 
 
 
1150 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  36.23 
 
 
347 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  30.38 
 
 
447 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  33.64 
 
 
342 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2601  putative signal transduction protein with NACHT domain  36.36 
 
 
100 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  31.87 
 
 
334 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  34.74 
 
 
323 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  32.81 
 
 
387 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>