27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5422 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  822    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  42.86 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  43.35 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  37.5 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  38.29 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  39.18 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  39.89 
 
 		 684 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  34.85 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1729  hypothetical protein  30.89 
 
 		 333 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.821516  normal  0.131387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  30.54 
 
 		 252 aa  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  26.11 
 
 		 1150 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.41 
 
 		 1044 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  29.63 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  27.56 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  27.11 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  37.11 
 
 		 593 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  30.32 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  24.7 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  33.64 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  29.51 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.14 
 
 		 2216 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0519  hypothetical protein  31.13 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1427 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  24.84 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  28.95 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2601  putative signal transduction protein with NACHT domain  31.17 
 
 		 100 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1185  hypothetical protein  28.03 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0012154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>