26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1812 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1729  hypothetical protein  74.85 
 
 		 333 aa  521  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.821516  normal  0.131387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  30.46 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  37.75 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  33.87 
 
 		 447 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  35.64 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  38.29 
 
 		 397 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  37.31 
 
 		 684 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  35.06 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  34.72 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  30.91 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  28.65 
 
 		 1150 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  31.61 
 
 		 2216 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  31.37 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  30.43 
 
 		 593 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  34.74 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 457 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  28.76 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1427 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  29.79 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0519  hypothetical protein  30.93 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.13 
 
 		 1044 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>