22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0873 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  38.11 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  32.14 
 
 		 353 aa  176  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  30.46 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  37.81 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  41.45 
 
 		 684 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  42.61 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  37.5 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1729  hypothetical protein  35.32 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.821516  normal  0.131387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  34.42 
 
 		 252 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  34.39 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  35.42 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  31.91 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 		 502 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  35.79 
 
 		 593 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  27.97 
 
 		 1150 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  30.39 
 
 		 419 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  31.87 
 
 		 457 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  32.58 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.28 
 
 		 1044 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  26.21 
 
 		 2216 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>