26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6797 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  39.83 
 
 
684 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  42.61 
 
 
362 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  36.63 
 
 
353 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  36.47 
 
 
334 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  33.91 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  34.85 
 
 
397 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  35.06 
 
 
334 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  38.89 
 
 
252 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1729  hypothetical protein  45.83 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.821516  normal  0.131387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  23.08 
 
 
1150 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  32.84 
 
 
593 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  35.79 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  29.53 
 
 
2216 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  32.94 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  33.73 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  28.23 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  35.37 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  33.02 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 
502 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  29.2 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  29.9 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  27.32 
 
 
389 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  30.21 
 
 
323 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  29.01 
 
 
1492 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0519  hypothetical protein  29.47 
 
 
394 aa  42.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>