12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2459 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  524  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  37.5 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  34.42 
 
 		 362 aa  99  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  34.64 
 
 		 447 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  34.72 
 
 		 334 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  38.69 
 
 		 684 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  30.54 
 
 		 397 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  34.87 
 
 		 353 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  38.89 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1729  hypothetical protein  39 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.821516  normal  0.131387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  30.3 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  23.81 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>