22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0585 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  864    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  48.94 
 
 		 1150 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  36.94 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  33.13 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2601  putative signal transduction protein with NACHT domain  43.28 
 
 		 100 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  31.37 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  34.41 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  29.27 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  29.63 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  31.91 
 
 		 346 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  32.94 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  36.36 
 
 		 684 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  26.47 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  37.36 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3982  hypothetical protein  40.38 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  30.39 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  32.98 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  32.41 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  30.3 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  30.23 
 
 		 2216 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>