29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0051 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  36.67 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  40.77 
 
 		 346 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  31.39 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  33.1 
 
 		 1150 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  36.96 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  35.87 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  25.83 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  27.56 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 508 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  34.74 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  36.36 
 
 		 362 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  28.21 
 
 		 334 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  40 
 
 		 2216 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 500 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 		 522 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  39.42 
 
 		 526 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  32.26 
 
 		 593 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  29.52 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  28.23 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  32.98 
 
 		 419 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  33.66 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1427 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1081  hypothetical protein  29.1 
 
 		 397 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  25.17 
 
 		 457 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3982  hypothetical protein  36.23 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2459  hypothetical protein  23.81 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  22.58 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>