20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1184 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  666    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  59.71 
 
 
342 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  32.85 
 
 
347 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1081  hypothetical protein  33.21 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1185  hypothetical protein  37.02 
 
 
389 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0012154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  37.87 
 
 
389 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0519  hypothetical protein  31.95 
 
 
394 aa  89  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  29 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  30.93 
 
 
1150 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3982  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2921  hypothetical protein  27.19 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.525203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  33.64 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0890  hypothetical protein  27.88 
 
 
218 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  29.7 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  28.57 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0784  hypothetical protein  27.08 
 
 
231 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  30.93 
 
 
684 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  34.74 
 
 
593 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  30.21 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  22.58 
 
 
280 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>