22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0219 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  805    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0519  hypothetical protein  29.79 
 
 
394 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1184  hypothetical protein  37.87 
 
 
323 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000411873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1081  hypothetical protein  33.85 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1185  hypothetical protein  31.82 
 
 
389 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0012154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  33.49 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  31.11 
 
 
347 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  27.32 
 
 
447 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  35.35 
 
 
346 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  33.65 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7458  hypothetical protein  33.66 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0297614  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  34.02 
 
 
684 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  31.43 
 
 
387 aa  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0051  hypothetical protein  33.66 
 
 
280 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  32.69 
 
 
1150 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0897  hypothetical protein  31.68 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  28.95 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.82 
 
 
1044 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5178  hypothetical protein  22.75 
 
 
329 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  27.32 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1884  hypothetical protein  27.36 
 
 
217 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>