36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4761 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  100 
 
 		 673 aa  1400    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  47.8 
 
 		 202 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  28.03 
 
 		 648 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  28.03 
 
 		 648 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  28.06 
 
 		 646 aa  108  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  28.06 
 
 		 646 aa  107  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  28.06 
 
 		 646 aa  107  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  27.71 
 
 		 648 aa  107  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  33.62 
 
 		 709 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  28.06 
 
 		 646 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  28 
 
 		 635 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  27.85 
 
 		 631 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  27.53 
 
 		 762 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 732 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 731 aa  93.6  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  25.73 
 
 		 703 aa  91.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  25.73 
 
 		 739 aa  92  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 404 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  29.3 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.93 
 
 		 682 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  28.93 
 
 		 605 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  25 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  28.22 
 
 		 1121 aa  76.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  26.24 
 
 		 1204 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 		 400 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 		 439 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7174  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 377 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00871383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  23.21 
 
 		 452 aa  48.1  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  21.69 
 
 		 431 aa  46.6  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  25 
 
 		 499 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  22.53 
 
 		 499 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  24.56 
 
 		 766 aa  45.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  22.53 
 
 		 499 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3003  hypothetical protein  27.96 
 
 		 98 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46664  predicted protein  20.89 
 
 		 554 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  26.32 
 
 		 614 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>