More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3884 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3884  oxidoreductase, zinc-binding protein  100 
 
 
320 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1600  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  95.31 
 
 
320 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0398631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1680  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  80.56 
 
 
320 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1322  alcohol dehydrogenase  74.06 
 
 
320 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0680057  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35160  Zinc-containing alcohol dehydrogenase-like protein  74.06 
 
 
320 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21890  putative oxidoreductase  73.04 
 
 
320 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1869  putative oxidoreductase  73.35 
 
 
320 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1720  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.88 
 
 
320 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161513  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1269  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  71.79 
 
 
320 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.731521  normal  0.0486073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3999  quinone oxidoreductase putative, PIG3  71.88 
 
 
320 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0207261  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1312  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  71.56 
 
 
320 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.303987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3042  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.84 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.44 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.43 
 
 
327 aa  251  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.1 
 
 
320 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.37 
 
 
332 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  45.11 
 
 
324 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.97 
 
 
334 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.13 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  43.63 
 
 
327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  43.63 
 
 
327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.63 
 
 
327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 
325 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  44.03 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.65 
 
 
323 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.23 
 
 
331 aa  239  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  43.27 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.17 
 
 
324 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.15 
 
 
324 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 
325 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.52 
 
 
320 aa  238  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  42.35 
 
 
325 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.76 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
333 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.86 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  44 
 
 
328 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.77 
 
 
329 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
334 aa  232  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.89 
 
 
317 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  43.67 
 
 
328 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.56 
 
 
343 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 
335 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0391  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.04 
 
 
335 aa  228  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
327 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  41.56 
 
 
328 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.02 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  40.72 
 
 
336 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.9 
 
 
326 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.9 
 
 
334 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  40.72 
 
 
336 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.31 
 
 
338 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  40.72 
 
 
336 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.77 
 
 
328 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0411  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.2 
 
 
329 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.67 
 
 
329 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  44.37 
 
 
329 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
345 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
345 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  41.88 
 
 
334 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
332 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  41.35 
 
 
327 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2167  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
327 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4023  alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.961336  unclonable  0.000000000225765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.62 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3289  oxidoreductase, zinc-binding  40.63 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.952299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.44 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.58 
 
 
334 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.48 
 
 
325 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
332 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.03 
 
 
329 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.64 
 
 
335 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.04 
 
 
333 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.78 
 
 
333 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  46.2 
 
 
318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.29 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.2 
 
 
332 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.46 
 
 
369 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40 
 
 
342 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  40.82 
 
 
329 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
332 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  40.52 
 
 
332 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02390  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  38.69 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.803043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40.76 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  41.29 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.87 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  41.37 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.75 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0533  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.67 
 
 
333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0360473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  40.26 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.8 
 
 
336 aa  212  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  41.56 
 
 
326 aa  211  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.62 
 
 
332 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
328 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  38.23 
 
 
389 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3672  alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
337 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.62 
 
 
338 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3411  alcohol dehydrogenase  38.78 
 
 
332 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0690188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>