More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3298 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  100 
 
 		 465 aa  944    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  93.53 
 
 		 465 aa  861    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  69.06 
 
 		 464 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.37 
 
 		 463 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.8 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.58 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.5 
 
 		 463 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.57 
 
 		 461 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  37.89 
 
 		 463 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 488 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  34.91 
 
 		 443 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  35.62 
 
 		 483 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 456 aa  226  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 468 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  33.95 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 486 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 515 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 486 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 489 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 490 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 488 aa  189  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 486 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  30.39 
 
 		 467 aa  176  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  30.39 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 482 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  37.31 
 
 		 499 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 487 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  37.14 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 467 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  31.24 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  35.42 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 472 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  33.55 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  37.92 
 
 		 476 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  37.55 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  31.22 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0275  sensor histidine kinase  33.54 
 
 		 571 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 464 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  30.18 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.95 
 
 		 415 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  33.91 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  26.56 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  36.1 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  34.29 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  31.17 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  36.83 
 
 		 419 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 469 aa  147  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.01 
 
 		 490 aa  130  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 465 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  32.57 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 386 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>