20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2007 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1249    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  50.46 
 
 		 877 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  35.03 
 
 		 539 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  29.42 
 
 		 609 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  30.4 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4028  hypothetical protein  31.69 
 
 		 216 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2013  hypothetical protein  32.68 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  30.37 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  27.3 
 
 		 504 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  25.23 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  30.49 
 
 		 635 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  25.95 
 
 		 607 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3070  hypothetical protein  22.92 
 
 		 355 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1430 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0241  hypothetical protein  22.97 
 
 		 254 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  28.57 
 
 		 692 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  24.15 
 
 		 602 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  22.9 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  24.79 
 
 		 669 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>