90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1417 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  353  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  96.65 
 
 		 179 aa  322  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  82.12 
 
 		 182 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  78.09 
 
 		 180 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  76.54 
 
 		 182 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  75.98 
 
 		 182 aa  253  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  75.71 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  78.16 
 
 		 176 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  77.59 
 
 		 176 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  78.16 
 
 		 177 aa  250  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  55.43 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  54.86 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  55.06 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  54.86 
 
 		 179 aa  194  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  54.29 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  57.63 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  52.81 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  53.22 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  57.06 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  57.71 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  57.71 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  57.14 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  56.74 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  53.93 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  52.38 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  40.74 
 
 		 263 aa  95.9  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000695  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.86494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  38.85 
 
 		 257 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  38.13 
 
 		 257 aa  92  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06571  hypothetical protein  42.18 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  34.04 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2643  17 kDa surface antigen  42.68 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.796605  normal  0.311018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  31.29 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1170  17 kDa surface antigen  54.88 
 
 		 120 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  34.5 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  29.45 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  43.37 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  36.53 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  30.72 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  35.76 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  52.17 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  52.17 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  52.17 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  54.35 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  52.17 
 
 		 272 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  52.17 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  52.17 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  52.17 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  52.17 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  54.35 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  52.17 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  32.86 
 
 		 376 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  54.35 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  52.17 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  54.76 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  52.17 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  38.17 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  38.17 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  35.53 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  47.92 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  47.92 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  34.45 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04299  17 kDa surface antigen family protein  56.52 
 
 		 126 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  34.09 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3476  17 kDa surface antigen  81.48 
 
 		 84 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  31.21 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  31.82 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  31.82 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  52.38 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  53.85 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  37.31 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  59.52 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  34.21 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  31.82 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1601  17 kDa surface antigen  34.73 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  42.59 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  33.78 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  39.73 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  41.51 
 
 		 160 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>