75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0378 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1601  17 kDa surface antigen  55.98 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1086  17 kDa surface antigen  56.35 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  57.79 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  47.2 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  47.5 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  33.72 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  35.14 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  37.12 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  37.12 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  37.12 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  37.12 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  37.12 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  35.44 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  38.97 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  36.08 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  35 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  35 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  35.38 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  35.38 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  40.91 
 
 		 180 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  38.97 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  38.52 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  33.8 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  34.29 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  38.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  34.67 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  32.85 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  35.38 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  35.38 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  34.13 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000036604  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  31.37 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  56.82 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  30.43 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  30.43 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  29.17 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  56.1 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  38.21 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  53.66 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  40.85 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  53.66 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  32.32 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  53.66 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  53.66 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  53.66 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  53.66 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  32.32 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  32.65 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  45.71 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  29.94 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  45.71 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  45.71 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  53.66 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  27.81 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  43.1 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 173 aa  42  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>