52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3351 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000036604  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  33.11 
 
 		 177 aa  90.9  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  32.76 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  33.53 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  31.32 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  34.91 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  30.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  29.51 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  29.21 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  29.12 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  28.65 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  28.65 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  29.12 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  29.12 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  30.9 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  29.12 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  29.12 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  33.56 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  28.09 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  29.25 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  31.65 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  27.89 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  30.82 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  30.82 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  32.8 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  30.19 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  28.25 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  31.91 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  26.92 
 
 		 376 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  29.66 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  30.9 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  28.97 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  30.5 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  30.5 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2730  hypothetical protein  26.4 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  29.01 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  36.63 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  28.14 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  25.84 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  25.28 
 
 		 179 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0312  hypothetical protein  25.32 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0282  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0943  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 104 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>