76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2643 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2643  17 kDa surface antigen  100 
 
 
280 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.796605  normal  0.311018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  64.64 
 
 
263 aa  345  5e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  59.41 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  59.41 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  46.5 
 
 
179 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  38.26 
 
 
179 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  38.26 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  38.26 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  38.26 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  38.26 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  38.26 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  38.26 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  40.14 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  40.14 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  40.14 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  40.14 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  38.26 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  38.26 
 
 
179 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  36.91 
 
 
175 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  37.58 
 
 
179 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  43.21 
 
 
179 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  43.4 
 
 
180 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  38.57 
 
 
178 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  44.23 
 
 
178 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  41.36 
 
 
182 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  40.74 
 
 
182 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  42.41 
 
 
182 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  41.98 
 
 
176 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  41.36 
 
 
176 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  41.36 
 
 
177 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  41.36 
 
 
180 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  40.85 
 
 
179 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  39.6 
 
 
179 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  40.85 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  40.85 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  40.14 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000695  hypothetical protein  49.19 
 
 
172 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.86494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  39.44 
 
 
179 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  39.44 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06571  hypothetical protein  49.19 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  39.62 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  36.5 
 
 
177 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  34.06 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  36.04 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  36.04 
 
 
204 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  34.92 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1170  17 kDa surface antigen  57.32 
 
 
120 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  60 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  60 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  60 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  60 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  32.43 
 
 
208 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  60 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  60 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  60 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  57.78 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  33.94 
 
 
217 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  30.95 
 
 
189 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  60 
 
 
216 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  59.09 
 
 
165 aa  52  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  57.78 
 
 
215 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  57.78 
 
 
215 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  59.09 
 
 
165 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  57.78 
 
 
216 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  32.79 
 
 
171 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04299  17 kDa surface antigen family protein  60.47 
 
 
126 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3351  histidine kinase  32.26 
 
 
185 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000036604  normal  0.060501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  39.17 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  38.36 
 
 
146 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  34.15 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2507  17 kDa surface antigen  36.88 
 
 
171 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.424442  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3476  17 kDa surface antigen  64.52 
 
 
84 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  41.03 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  54.29 
 
 
155 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  32.85 
 
 
190 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>