More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1574 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  49.79 
 
 		 857 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  49.79 
 
 		 857 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  49.65 
 
 		 865 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0625  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  51.32 
 
 		 854 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0977659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  42.23 
 
 		 863 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50 
 
 		 859 aa  671    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0564  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.16 
 
 		 869 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.93 
 
 		 859 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0224  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  42.54 
 
 		 853 aa  661    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  50 
 
 		 862 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1287  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50 
 
 		 866 aa  670    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  50.7 
 
 		 861 aa  675    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  50.87 
 
 		 874 aa  686    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  49.51 
 
 		 857 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  52.22 
 
 		 854 aa  703    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1090  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  51.31 
 
 		 866 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.930784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1072  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  51.31 
 
 		 866 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1066  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  51.16 
 
 		 866 aa  657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.226662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.51 
 
 		 865 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  50.91 
 
 		 858 aa  701    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  50.91 
 
 		 858 aa  701    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  51.94 
 
 		 854 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  50.42 
 
 		 865 aa  690    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  50.14 
 
 		 863 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0200  ATPase  50.91 
 
 		 867 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371355  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0016  ATPase  42.23 
 
 		 863 aa  711    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1574  ATPase  100 
 
 		 931 aa  1869    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.513125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  49.86 
 
 		 862 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0645  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.38 
 
 		 857 aa  674    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  48.51 
 
 		 891 aa  692    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  43.68 
 
 		 873 aa  745    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  46.32 
 
 		 876 aa  777    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  44.64 
 
 		 872 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  49.51 
 
 		 865 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  50.7 
 
 		 865 aa  700    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4834  chaperone clpB  51.64 
 
 		 854 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0201945  normal  0.188995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  42.78 
 
 		 870 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0359  heat shock protein ClpB-like  47.49 
 
 		 872 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  49.51 
 
 		 865 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  43.77 
 
 		 862 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2159  ATPase  58.55 
 
 		 941 aa  1028    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.513244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  43.74 
 
 		 862 aa  717    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2474  ATPase  57.22 
 
 		 924 aa  1008    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.786045  normal  0.0534702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  50.21 
 
 		 864 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1661  ATPase  41.68 
 
 		 863 aa  662    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0414  AAA ATPase  50.98 
 
 		 854 aa  672    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.817995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1177  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  51.31 
 
 		 866 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0209  ATPase  50 
 
 		 918 aa  885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0580  ATPase  40.37 
 
 		 860 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.791639  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0637  ATPase  54.89 
 
 		 895 aa  719    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0120026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  45.4 
 
 		 883 aa  771    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  49.72 
 
 		 869 aa  675    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  50 
 
 		 870 aa  677    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.37 
 
 		 865 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  43.82 
 
 		 870 aa  675    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  49.51 
 
 		 879 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  48.23 
 
 		 859 aa  678    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1289  ATPase AAA-2  49.06 
 
 		 865 aa  660    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00235636  normal  0.153454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0119  ClpB protein  49.49 
 
 		 854 aa  676    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0367  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.64 
 
 		 857 aa  672    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  42.37 
 
 		 871 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  49.36 
 
 		 870 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2548  ClpB protein  50.28 
 
 		 876 aa  670    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  50.07 
 
 		 879 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  49.3 
 
 		 861 aa  673    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  50.64 
 
 		 866 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  49.44 
 
 		 865 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2861  ATPase AAA-2  49.24 
 
 		 862 aa  685    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  42.86 
 
 		 869 aa  666    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  49.93 
 
 		 879 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  49.86 
 
 		 860 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  48.73 
 
 		 878 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  50.42 
 
 		 865 aa  687    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  44.96 
 
 		 862 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0194  ATP-dependent chaperone protein ClpB  46.84 
 
 		 862 aa  669    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.68228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  49.36 
 
 		 878 aa  676    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  51.52 
 
 		 861 aa  679    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  42.3 
 
 		 862 aa  696    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  42.56 
 
 		 859 aa  694    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  49.37 
 
 		 865 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  47.68 
 
 		 848 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  52.28 
 
 		 858 aa  694    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  50.28 
 
 		 891 aa  702    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  50.71 
 
 		 856 aa  690    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  43.98 
 
 		 870 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3490  ATPase AAA-2  46.17 
 
 		 905 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  49.22 
 
 		 857 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  49.22 
 
 		 857 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  50.28 
 
 		 864 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  49.37 
 
 		 865 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  43.26 
 
 		 868 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  48.89 
 
 		 865 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  50.9 
 
 		 854 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  48.58 
 
 		 889 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  49.37 
 
 		 865 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  42.21 
 
 		 873 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0147  ATPase  50.35 
 
 		 861 aa  668    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.919618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  49.22 
 
 		 857 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  49.36 
 
 		 875 aa  677    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  48.34 
 
 		 857 aa  677    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>