188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84906 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  51 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  48.5 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  34.8 
 
 		 231 aa  92  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  34.8 
 
 		 231 aa  92  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  33.18 
 
 		 233 aa  92  9e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  33.92 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  27.78 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  29.13 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  27.52 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  32.54 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  29.33 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  31.07 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  28.1 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  27.57 
 
 		 224 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  38.26 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  40.68 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  30.52 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  40.34 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  40.34 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  27.72 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  34.91 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  27.23 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  27.63 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  26.5 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  26.64 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  25.56 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  38.66 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  39.5 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  26.95 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  27.23 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  37.29 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  25.11 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  26.37 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  30.05 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  30.05 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  35.59 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  35.59 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  35.59 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4993  hypothetical protein  35.25 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  35.59 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  31.72 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  35.29 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  35.48 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  28.44 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  30.99 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  28.98 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  34.68 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  34.68 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  33.33 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  26.79 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  32.89 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  26.7 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  31.47 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  30.95 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  33.61 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  28.57 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  33.33 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  29.39 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  29.23 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  26.42 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  34.19 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  26.42 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  26 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  24.44 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  33.61 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  24 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14561  predicted protein  27.33 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1268  integral membrane protein, interacts with FtsH  30.61 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.01414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2141  hypothetical protein  26.92 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000126118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  25.51 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  33.9 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  31.14 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  25.78 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  33.9 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  29.6 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  28.89 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  26 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  29.33 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  29.6 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  29.33 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  28.8 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  25.21 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  26.55 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  32 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  25.6 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  28.67 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  25.45 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  27.97 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  25.11 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  32.2 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  29.6 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  24.8 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>