31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14561 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14561  predicted protein  100 
 
 		 172 aa  353  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  26.19 
 
 		 270 aa  62  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  29.65 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  27.33 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  30.57 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4993  hypothetical protein  28.33 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  29.41 
 
 		 224 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1268  integral membrane protein, interacts with FtsH  26.01 
 
 		 240 aa  47.8  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.01414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  29.7 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  29.37 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  26.63 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0393  protein of unknown function UPF0005  37.14 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  28.65 
 
 		 233 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1092  hypothetical protein  30.97 
 
 		 248 aa  45.1  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  27.39 
 
 		 256 aa  44.7  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  28.08 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181817  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  27.66 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  28.68 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  29.59 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  27.59 
 
 		 256 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  28.95 
 
 		 235 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  27.11 
 
 		 233 aa  42  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3648  protein of unknown function UPF0005  28.65 
 
 		 241 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000291773  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  35.59 
 
 		 228 aa  41.2  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  32.46 
 
 		 236 aa  41.2  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  29.5 
 
 		 246 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  32.03 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  29.5 
 
 		 246 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  34.82 
 
 		 242 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  28.06 
 
 		 246 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>