155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0393 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0393  protein of unknown function UPF0005  100 
 
 		 228 aa  436  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3648  protein of unknown function UPF0005  33.78 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000291773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  38.43 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  36.86 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  37.05 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  31.44 
 
 		 233 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  34.96 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  35.51 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  35.51 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  35.85 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  36.07 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  40.38 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  33.48 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  34.08 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  35.85 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  36.93 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  35.05 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  34.74 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  33.91 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  38.22 
 
 		 274 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  37.58 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  34.76 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  36.54 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  30.51 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  36.57 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  36.57 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  36.57 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  31.33 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  37.58 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  34.33 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  31.76 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  32.13 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  39.18 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  31.76 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  38.22 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  40.51 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  33.96 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  39.1 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  31.45 
 
 		 261 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  38 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  35.98 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  35.98 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1268  integral membrane protein, interacts with FtsH  31.34 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.01414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  35.98 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  35.98 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  40.76 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  29.46 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  38.22 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  32.27 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  35.98 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  35.51 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  29.33 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  29.26 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  30.04 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  33.91 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  39.87 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  35.39 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  29.15 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  34.5 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  38.93 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  29.78 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  32.17 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  35.2 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  34.83 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  32.88 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  30.99 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  36.54 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1882  integral membrane protein  35.32 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.302191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0308  hypothetical protein  35.32 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0260  protein of unknown function UPF0005  27.5 
 
 		 259 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0529527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  40.41 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  32.86 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3668  hypothetical protein  28.23 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16725  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  32.86 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  32.76 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  32.39 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2141  hypothetical protein  33.5 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000126118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  37.34 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0302  hypothetical protein  32.68 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171893  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  30.94 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2268  hypothetical protein  34.43 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  35.48 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  35.95 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  33.76 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  32.76 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1228  hypothetical protein  32.29 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181817  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  34.87 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419647  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  30.49 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  30.49 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0129  hypothetical protein  33.48 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.576127 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  34.42 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  31.61 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0009  hypothetical protein  32.68 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.0000179437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  34.84 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>