More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81735 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  100 
 
 
367 aa  749    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  72.5 
 
 
378 aa  555  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  65.85 
 
 
368 aa  489  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  57.34 
 
 
373 aa  418  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  55.62 
 
 
374 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  53.46 
 
 
410 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  53.02 
 
 
367 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  53.54 
 
 
407 aa  369  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  48.52 
 
 
367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  48.51 
 
 
368 aa  346  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  49.18 
 
 
369 aa  335  1e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  46.61 
 
 
363 aa  328  8e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  46.22 
 
 
367 aa  328  8e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  47.25 
 
 
364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.01 
 
 
370 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  46.76 
 
 
369 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  45.72 
 
 
370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  45.48 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  45.78 
 
 
371 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  45.68 
 
 
369 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  45.68 
 
 
369 aa  295  9e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  46.35 
 
 
370 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  46.22 
 
 
369 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  41.03 
 
 
365 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  40.11 
 
 
369 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  39 
 
 
370 aa  239  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  41.5 
 
 
368 aa  236  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  38.29 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  39.83 
 
 
370 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  40.72 
 
 
371 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.34 
 
 
389 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  30.41 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  27.73 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  25.66 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  26.98 
 
 
377 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  27.32 
 
 
357 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  27.25 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  25.07 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  26.43 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  26.84 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  26.7 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  26.7 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.01 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  40.18 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  37.3 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  30.77 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  31.74 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.67 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  37.3 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  37.3 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  38.1 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.85 
 
 
452 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  45.98 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.03 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.48 
 
 
438 aa  76.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  48.28 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  38.21 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  29.3 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.03 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  26.61 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  34.13 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  34.13 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  28.14 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  37.68 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  36.51 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  34.92 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  30.77 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  35.71 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.28 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  41.57 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  39.05 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  31.46 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  41.9 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  31.46 
 
 
405 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.51 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  42.86 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  48.28 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  29.31 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  42.06 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.88 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.54 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  35.48 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  29.31 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  34.92 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  34.13 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  34.4 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.87 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  38.78 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  42.06 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  34.92 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  45.98 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.19 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  33.56 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  33.56 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  34.13 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  29.51 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  43.68 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.54 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  34.13 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  34.13 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>