More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63831 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  69.8 
 
 		 227 aa  302  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  57.29 
 
 		 223 aa  225  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  56.44 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00785  mitochondrial superoxide dismutase (Eurofung)  48.48 
 
 		 213 aa  187  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  47.26 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  48.24 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  46.23 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  44.44 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  46.46 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  48.48 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  43.65 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  45.45 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  47.24 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  47.72 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  45.54 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  46.97 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  47.24 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  43.78 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  43.78 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  47.87 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  46.46 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  42.5 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  44.95 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  46.83 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  46.28 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  47.32 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  46.83 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  42.64 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  44.88 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  42.27 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  42.06 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  45.85 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  45.85 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  44.33 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  44.33 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  41.15 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  43.35 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  41.95 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  39.9 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  43 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  43.54 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  45.05 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  40.61 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  44.17 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  41.55 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  41.75 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  43.06 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  42.93 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  42.72 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  40.55 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  43.75 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  41.94 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  39.39 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  43.41 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  44.12 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  39.39 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  41.95 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  39.59 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  42.93 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  38.66 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  41.95 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  41.23 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  41.12 
 
 		 208 aa  147  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  42.58 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  43 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  42.92 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  40.1 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  41.67 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0119  superoxide dismutase  38.83 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000118363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  38.28 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0124  superoxide dismutase  38.83 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00649836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  42.93 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  41.35 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  39.72 
 
 		 268 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  41.59 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  42.65 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  42.65 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  42.65 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  42.65 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  42.65 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  38.38 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  40 
 
 		 240 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  42.18 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  42.18 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  42.18 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  42.18 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  42.18 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>