More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54281 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_54281  Mitochondrial RNA helicase of the DEAD box family  100 
 
 
468 aa  963    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0633704 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 
607 aa  207  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  33.58 
 
 
567 aa  206  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  35.29 
 
 
567 aa  206  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  32.71 
 
 
545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05150  conserved hypothetical protein  34.97 
 
 
606 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  31.66 
 
 
609 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  33.59 
 
 
474 aa  193  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00894  DEAD box RNA helicase HelA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15620)  32.72 
 
 
641 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.859671  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.71 
 
 
450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.71 
 
 
450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  34.47 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  31.51 
 
 
589 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.22 
 
 
458 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  34.87 
 
 
450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.87 
 
 
450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.22 
 
 
450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.62 
 
 
447 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.38 
 
 
454 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24935  helicase_1  31.82 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
482 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43135  predicted protein  30.26 
 
 
587 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  32.8 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0750  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.71 
 
 
463 aa  173  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  31.65 
 
 
528 aa  172  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.55 
 
 
625 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  32.55 
 
 
579 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.79 
 
 
581 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2893  DEAD/DEAH box helicase-like  33.06 
 
 
423 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.85 
 
 
590 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  33.74 
 
 
465 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  34.59 
 
 
481 aa  170  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.5 
 
 
561 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.03 
 
 
546 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  31.94 
 
 
405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.79 
 
 
546 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2952  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.73 
 
 
419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.01 
 
 
591 aa  166  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.65 
 
 
558 aa  166  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.63 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2189  putative ATP-dependent RNA helicase  32.81 
 
 
398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.26 
 
 
530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  31.27 
 
 
583 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0224275 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.08 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  31.29 
 
 
589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00220  RNA helicase, putative  31.25 
 
 
710 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.063496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.83 
 
 
460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.85 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2402  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.92 
 
 
634 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.208521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.06 
 
 
602 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.96 
 
 
514 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.83 
 
 
511 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.52 
 
 
532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  32.46 
 
 
485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  31.07 
 
 
589 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
541 aa  163  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1236  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.28 
 
 
408 aa  163  7e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  31.13 
 
 
529 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  32.79 
 
 
812 aa  162  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  31.38 
 
 
528 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62830  ATP dependent RNA helicase  30.82 
 
 
617 aa  162  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0490658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.38 
 
 
525 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.5 
 
 
561 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  31.38 
 
 
533 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.38 
 
 
528 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  31.38 
 
 
528 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.38 
 
 
528 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  31.38 
 
 
525 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1511  predicted protein  29.95 
 
 
560 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.485737  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  31.38 
 
 
528 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47095  predicted protein  32.72 
 
 
413 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0903334  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.68 
 
 
623 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  31.97 
 
 
533 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_1794  predicted protein  34.3 
 
 
421 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00327182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.71 
 
 
643 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.03 
 
 
498 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1847  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.72 
 
 
457 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17862  predicted protein  33.33 
 
 
529 aa  161  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1509  DNA topoisomerase III  30.39 
 
 
398 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.569341  hitchhiker  0.00000206936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.05 
 
 
516 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.35 
 
 
460 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 
441 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.87 
 
 
538 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.13 
 
 
565 aa  159  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31 
 
 
417 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  31.42 
 
 
530 aa  159  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.13 
 
 
451 aa  159  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.16 
 
 
585 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  30.71 
 
 
765 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0076  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.61 
 
 
452 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000113664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.5 
 
 
474 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.75 
 
 
510 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2544  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
680 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.711022  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  30.83 
 
 
561 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
510 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31 
 
 
453 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.32 
 
 
466 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.96 
 
 
405 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>