More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34151 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  100 
 
 
227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  69.8 
 
 
208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  55.11 
 
 
223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  47.53 
 
 
225 aa  206  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  46.15 
 
 
224 aa  190  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  48.21 
 
 
206 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  47.21 
 
 
207 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  47.21 
 
 
207 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  47.21 
 
 
207 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  46.94 
 
 
209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  46.46 
 
 
208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  46.15 
 
 
209 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  47.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  46.15 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  47.45 
 
 
200 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00785  mitochondrial superoxide dismutase (Eurofung)  45.69 
 
 
213 aa  176  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  44.44 
 
 
226 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  44.44 
 
 
208 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  43.81 
 
 
207 aa  175  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  44.33 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  42.58 
 
 
207 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  47.21 
 
 
204 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  45.13 
 
 
204 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  45 
 
 
207 aa  167  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  46.28 
 
 
209 aa  168  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  45.21 
 
 
207 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  44.39 
 
 
203 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  44.62 
 
 
207 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  42.35 
 
 
299 aa  161  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  46.97 
 
 
209 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  41.46 
 
 
209 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  41.54 
 
 
203 aa  158  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  37.05 
 
 
226 aa  156  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  43.2 
 
 
203 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  38.07 
 
 
202 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  41.79 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  42.23 
 
 
206 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  40.59 
 
 
204 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  44.93 
 
 
203 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  40.2 
 
 
200 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  43.07 
 
 
201 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  41.43 
 
 
211 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  44.44 
 
 
241 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  41.55 
 
 
203 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  41.55 
 
 
203 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  41.55 
 
 
203 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  41.55 
 
 
203 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  41.55 
 
 
203 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  41.55 
 
 
203 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  41.55 
 
 
203 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  41.55 
 
 
203 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  44.44 
 
 
210 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  43.14 
 
 
203 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  39.9 
 
 
203 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  40.59 
 
 
204 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  40.3 
 
 
200 aa  148  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  44.93 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  41.06 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  41.55 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  39.49 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  40.1 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  42.58 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  38.58 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  40.67 
 
 
206 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  41.15 
 
 
206 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  41.79 
 
 
201 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  40.67 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  40.67 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  40.67 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  40.67 
 
 
206 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  40.67 
 
 
206 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  40.67 
 
 
206 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  40.67 
 
 
206 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  40.67 
 
 
206 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  39.81 
 
 
202 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  39.9 
 
 
201 aa  145  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  41.15 
 
 
207 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  41.15 
 
 
207 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  42.79 
 
 
202 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  41.15 
 
 
207 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3359  Superoxide dismutase  42.36 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  38.73 
 
 
209 aa  144  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  41.15 
 
 
208 aa  144  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  37.95 
 
 
304 aa  144  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  39.11 
 
 
199 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  37.95 
 
 
304 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  40.19 
 
 
206 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  41.15 
 
 
206 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  40.19 
 
 
206 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  39.11 
 
 
199 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  40.19 
 
 
206 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  37.95 
 
 
304 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  40.19 
 
 
206 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  43.41 
 
 
203 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  39.42 
 
 
261 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  43.69 
 
 
203 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  42.25 
 
 
209 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  37.95 
 
 
304 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  37.95 
 
 
304 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  37.95 
 
 
304 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>