102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48178 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48178  predicted protein  100 
 
 
457 aa  935    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.880924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  26.35 
 
 
263 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  27.44 
 
 
269 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  25.08 
 
 
276 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  27.08 
 
 
271 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  25.73 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  32.43 
 
 
231 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  25.23 
 
 
288 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  23.55 
 
 
288 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  27.16 
 
 
256 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  27.16 
 
 
249 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  24.83 
 
 
308 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  22.68 
 
 
228 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  25.7 
 
 
517 aa  57  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  25.4 
 
 
325 aa  57  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 
509 aa  56.6  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  23.26 
 
 
276 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  21.82 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4869  Ion transport 2 domain-containing protein  25.33 
 
 
271 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  22.99 
 
 
303 aa  55.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  25.4 
 
 
325 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1178  Ion transport 2  25.75 
 
 
267 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  22.88 
 
 
288 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  22.75 
 
 
276 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  26.74 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  25.2 
 
 
277 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01080  conserved hypothetical protein  22.32 
 
 
554 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160096  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3759  Ion transport 2 domain-containing protein  24.54 
 
 
265 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  27.14 
 
 
294 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  19.43 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  24.11 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  21.59 
 
 
282 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  29.71 
 
 
267 aa  51.2  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  23.33 
 
 
283 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  31.13 
 
 
344 aa  50.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  22.32 
 
 
276 aa  50.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  22.57 
 
 
290 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28616  VIC family transporter: potassium ion channel  25 
 
 
400 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  22.26 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  24.66 
 
 
256 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  24.77 
 
 
311 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  22.22 
 
 
274 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  23.76 
 
 
299 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2720  Ion transport protein  24.38 
 
 
258 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  21.73 
 
 
276 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  24.09 
 
 
305 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  22.65 
 
 
212 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  25.97 
 
 
265 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  20.87 
 
 
277 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  21.92 
 
 
316 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  26.88 
 
 
258 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  23.39 
 
 
297 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  24.06 
 
 
258 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  27.42 
 
 
273 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  24.26 
 
 
297 aa  47  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  26.88 
 
 
258 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  22.96 
 
 
283 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  23.76 
 
 
256 aa  46.6  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  24.4 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  30.34 
 
 
268 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  22.74 
 
 
278 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  23.27 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  18.75 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  20.56 
 
 
277 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  28.09 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  22.93 
 
 
284 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  20.96 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  27.19 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  22.38 
 
 
278 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  22.38 
 
 
278 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  22.38 
 
 
278 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  30.84 
 
 
274 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  22.52 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  24.55 
 
 
295 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  30.86 
 
 
260 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  30.86 
 
 
260 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  30.86 
 
 
260 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  22.59 
 
 
287 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  20.59 
 
 
273 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  23.19 
 
 
295 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  28.69 
 
 
251 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  20.59 
 
 
273 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4579  Ion transport 2 domain-containing protein  26.35 
 
 
256 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.29628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  22.38 
 
 
278 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5039  Ion transport 2 domain protein  26.35 
 
 
256 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.103655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1838  Ion transport 2 domain protein  22.94 
 
 
264 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  23.56 
 
 
531 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  25.41 
 
 
302 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.16 
 
 
409 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  19.76 
 
 
273 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  25.41 
 
 
303 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  29.53 
 
 
270 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  24.69 
 
 
272 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  25.96 
 
 
417 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  25.96 
 
 
417 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  25.96 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  25.96 
 
 
417 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  25.96 
 
 
402 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  25.96 
 
 
417 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  25.96 
 
 
402 aa  43.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>