82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28616 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28616  VIC family transporter: potassium ion channel  100 
 
 
400 aa  814    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18703  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily G  36.18 
 
 
493 aa  123  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0212118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  26 
 
 
263 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  26.48 
 
 
269 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  25.5 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  26.09 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  27.92 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  23.93 
 
 
282 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  28.98 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  24.32 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  23.14 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  24.72 
 
 
282 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  23.9 
 
 
276 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  25.81 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  26.17 
 
 
278 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  26.17 
 
 
278 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  25.9 
 
 
283 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  26.17 
 
 
278 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  24.21 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  26.17 
 
 
278 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  25.4 
 
 
277 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  27.13 
 
 
273 aa  60.5  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  25.58 
 
 
278 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  24.08 
 
 
284 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  24.08 
 
 
284 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  29.49 
 
 
297 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  28.85 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  24.08 
 
 
284 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  24.08 
 
 
284 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  25.2 
 
 
271 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  28.51 
 
 
272 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  23.62 
 
 
276 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  24.3 
 
 
282 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  25.55 
 
 
279 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  24 
 
 
289 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  25.61 
 
 
303 aa  56.6  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  25.3 
 
 
283 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  23.49 
 
 
276 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  23.67 
 
 
289 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  23.67 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  25 
 
 
288 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  24.5 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  21.46 
 
 
295 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  23.67 
 
 
289 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  26.07 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  24.82 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  24 
 
 
273 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  24 
 
 
273 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  24.81 
 
 
288 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  22.39 
 
 
276 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  23.6 
 
 
273 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  21.97 
 
 
279 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  30.68 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  23.17 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  23.53 
 
 
274 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  24.4 
 
 
280 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  22.83 
 
 
282 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  23.11 
 
 
287 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  23.02 
 
 
279 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  27.56 
 
 
256 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48178  predicted protein  24.86 
 
 
457 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.880924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  26.63 
 
 
228 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  22.42 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  22.18 
 
 
258 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  24.29 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  34.11 
 
 
531 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  25.4 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  25.33 
 
 
289 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  26.61 
 
 
272 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  23.83 
 
 
266 aa  47.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  25.86 
 
 
268 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  25.9 
 
 
240 aa  46.6  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  25 
 
 
272 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  29.55 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  36.56 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  27.22 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  25.97 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.95 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  26.9 
 
 
325 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  22.05 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  23.19 
 
 
212 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  26.29 
 
 
325 aa  43.1  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>