More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11652 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11652  predicted protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0131  translation initiation factor IF-3  52.97 
 
 		 217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.122365  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  47.22 
 
 		 177 aa  164  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0085  translation initiation factor IF-3  52.43 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01551  translation initiation factor IF-3  52.43 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17631  translation initiation factor IF-3  51.35 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18271  translation initiation factor IF-3  52.97 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.125602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1215  translation initiation factor IF-3  51.4 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1729  translation initiation factor IF-3  52.43 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20901  translation initiation factor IF-3  51.35 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.240556  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18461  translation initiation factor IF-3  52.43 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18251  translation initiation factor IF-3  51.89 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412706  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  44.51 
 
 		 178 aa  157  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  43.68 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  43.68 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  45.66 
 
 		 177 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 204 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  50.69 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  48.61 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  44.2 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  40.91 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  44.58 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  40.91 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  42.53 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  45.09 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  47.34 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  40.83 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  47.34 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  41.71 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  39.11 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  42.37 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  43.45 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  42.11 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  40.64 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  38.46 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  40.8 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  48.23 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  41.52 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  43.2 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  43.37 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  43.11 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  42.77 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  38.12 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  38.46 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  38.46 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  41.57 
 
 		 238 aa  137  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 277 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  40.88 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 186 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  41.42 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 134 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 134 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  41.38 
 
 		 197 aa  137  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  40.24 
 
 		 415 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  40.11 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  39.11 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  41.57 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  41.57 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  47.59 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  41.57 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  41.04 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  40.33 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  42.38 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  41.57 
 
 		 243 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  41.04 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  41.04 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  37.57 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  43.05 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  46.26 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  45.14 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  40.11 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  40.96 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  41.52 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  39.64 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  39.43 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  39.78 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  42.6 
 
 		 175 aa  134  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  43.93 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  41.07 
 
 		 401 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  37.71 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  39.52 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  45.14 
 
 		 151 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>