More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2957 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  98.33 
 
 		 360 aa  736    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  100 
 
 		 360 aa  746    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  76.18 
 
 		 368 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  76.18 
 
 		 368 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  75.9 
 
 		 366 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  72.85 
 
 		 369 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  61.77 
 
 		 361 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  60.39 
 
 		 361 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  60.39 
 
 		 361 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  58.71 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  56.46 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  55.65 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.9 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.15 
 
 		 370 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.46 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  56.67 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  55.24 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  54.78 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 		 370 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 		 370 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 		 370 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 		 370 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  54.92 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  58.99 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  54.87 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  53.06 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  54.21 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  53.63 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  54.78 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  56.11 
 
 		 380 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.15 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.06 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  53.2 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  53.2 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  51.94 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  53.2 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  53.65 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.93 
 
 		 369 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  52.39 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.06 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  54.21 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.76 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  52.38 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.76 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.38 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  53.35 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  51.94 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  54.04 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  53.65 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  54.29 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  52.96 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  54.49 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.65 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  53.89 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  53.87 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  52.66 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  51.97 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  52.79 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.91 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0880635  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.37 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  51.53 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  52.1 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  51.67 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  57.59 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  51.26 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  52.38 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  54.47 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  52.27 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  53.07 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  52.27 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  54.44 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  51.26 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  50.42 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  51.4 
 
 		 344 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.63 
 
 		 359 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  52.53 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  52.97 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  52.82 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  53.61 
 
 		 332 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  50.98 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  56.97 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  53.61 
 
 		 332 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  52.82 
 
 		 365 aa  359  5e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>