213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0184 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0184  metallophosphoesterase  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0094  metallophosphoesterase  42.64 
 
 
268 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532674  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0128  metallophosphoesterase  39.68 
 
 
274 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0127  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
274 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0173  metallophosphoesterase  38.89 
 
 
273 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3152  metallophosphoesterase  39.92 
 
 
274 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.495281  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0172  metallophosphoesterase  39.09 
 
 
274 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1464  putative cAMP phosphodiesterase  38.43 
 
 
275 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2652  metallophosphoesterase  38.59 
 
 
275 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248464  normal  0.529788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.92 
 
 
274 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3554  hypothetical protein  38.71 
 
 
266 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3077  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
354 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
325 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1208  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0659  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  37.5 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.226857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1412  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0494  Ser/Thr protein phosphatase family protein  37.5 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  34.39 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  33.46 
 
 
277 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  37.18 
 
 
275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  36.6 
 
 
278 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  35.34 
 
 
285 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4339  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  36.78 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
286 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  35.02 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2078  metallophosphoesterase  35.42 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293005  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1667  metallophosphoesterase  35.27 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1112  metallophosphoesterase  37.55 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1113  metallophosphoesterase  37.65 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  29.44 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3876  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1414  metallophosphoesterase  32.8 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.314571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
289 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0749  metallophosphoesterase  36.25 
 
 
274 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1230  metallophosphoesterase  36.25 
 
 
274 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1204  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189904  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0346  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  35.51 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  35.51 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  34.87 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0549  metallophosphoesterase  33.61 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1795  hypothetical protein  32.8 
 
 
282 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.0189178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0497  metallophosphoesterase  32.77 
 
 
271 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  33.18 
 
 
274 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.75 
 
 
277 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6665  metallophosphoesterase  31.94 
 
 
275 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0199222  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3268  metallophosphoesterase  32.73 
 
 
274 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  34.58 
 
 
266 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  33.59 
 
 
277 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5850  hypothetical protein  34.03 
 
 
280 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248293  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3384  metallophosphoesterase  32.27 
 
 
273 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4965  Ser/Thr protein phosphatase  31.28 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2554  metallophosphoesterase  35.18 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3316  metallophosphoesterase  31.8 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0363179  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0606  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  31.67 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0979  metallophosphoesterase  33.21 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65690  hypothetical protein  30 
 
 
272 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  31.54 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5698  hypothetical protein  30.42 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1783  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
276 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3616  Calcineurin phosphoesterase domain protein  33.01 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2148  metallophosphoesterase  30.2 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4917  icc protein  30.17 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4793  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  30.17 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  33.48 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3774  Calcineurin phosphoesterase domain protein  32.54 
 
 
275 aa  89  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  29.67 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3490  metallophosphoesterase  30.86 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4534  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4970  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  30.17 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3506  metallophosphoesterase  30.73 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0806  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  29.11 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0192  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4265  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  33.17 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2836  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.214717  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4709  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  30.6 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.771801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0561  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2298  Calcineurin phosphoesterase domain protein  29.87 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10820  hypothetical protein  30 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0698  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
309 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3329  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  25.56 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3358  cyclic AMP phosphodiesterase  28.15 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0573033 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0061  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.73 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3222  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00294864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  31.55 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0576  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.58 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  27.53 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1772  ICC (3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase) protein  33.01 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131867  normal  0.0325302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9340  putative ICC protein  27.31 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365047  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  30.1 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  31.88 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  31.88 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4192  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  26.64 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>