More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0030 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  78.56 
 
 		 460 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  96.99 
 
 		 465 aa  955    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  100 
 
 		 470 aa  988    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  78.34 
 
 		 460 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  78.99 
 
 		 460 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  66.74 
 
 		 470 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  78.77 
 
 		 460 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  78.34 
 
 		 462 aa  771    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  79.21 
 
 		 460 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  62.66 
 
 		 461 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  59.7 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  56.4 
 
 		 461 aa  569  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  55.65 
 
 		 460 aa  548  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  52.48 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  53.95 
 
 		 457 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  53.17 
 
 		 459 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  54.21 
 
 		 461 aa  535  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  52.17 
 
 		 459 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  51.3 
 
 		 459 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  49.89 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.28 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  49.15 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  42.64 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  41.89 
 
 		 478 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  41.45 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  40.79 
 
 		 478 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  39.56 
 
 		 452 aa  343  5e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  39.78 
 
 		 475 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  35.56 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  35.29 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  35.08 
 
 		 446 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  38.34 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  34.79 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  35.7 
 
 		 465 aa  299  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  36.24 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  35.24 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  35.18 
 
 		 451 aa  295  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  33.84 
 
 		 471 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  34.35 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  35.31 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  35.15 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  34.57 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  35.17 
 
 		 469 aa  289  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  36.76 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  35.32 
 
 		 457 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  35.01 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  34.66 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  34.54 
 
 		 468 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  34.72 
 
 		 459 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  35.11 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  37.11 
 
 		 447 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  32.75 
 
 		 452 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  32.9 
 
 		 488 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  34.45 
 
 		 438 aa  276  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  34.89 
 
 		 469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  33.62 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  35.44 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  34.25 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  33.95 
 
 		 517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  33.98 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  32.71 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  34.73 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  35.59 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  34.21 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  32.61 
 
 		 452 aa  267  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  34.54 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  33.84 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  32.74 
 
 		 445 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  33.41 
 
 		 439 aa  266  8e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  33.61 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  32.19 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  31.56 
 
 		 487 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  33.12 
 
 		 472 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  33.19 
 
 		 474 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  34.45 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  33.97 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  33.12 
 
 		 461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 468 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  32.29 
 
 		 478 aa  259  6e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  33.55 
 
 		 909 aa  259  9e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  35.36 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  32.43 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  32.9 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  32.02 
 
 		 462 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  33.41 
 
 		 478 aa  256  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  31.36 
 
 		 475 aa  255  9e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  34.03 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  33.41 
 
 		 453 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  32.67 
 
 		 470 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  33.04 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  32.46 
 
 		 489 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 465 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  34.17 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  32.31 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  34.13 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  31.66 
 
 		 466 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  34.59 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  33.19 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  33.26 
 
 		 470 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  32.31 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>