More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58375 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5112  metallopeptidase  91.11 
 
 
405 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  100 
 
 
405 aa  828    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  75.92 
 
 
409 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  61.44 
 
 
412 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  60.79 
 
 
405 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  58.81 
 
 
405 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  58.81 
 
 
405 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  59.16 
 
 
404 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  61.14 
 
 
403 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  58.93 
 
 
420 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  58.4 
 
 
401 aa  471  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  54.05 
 
 
409 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0888  peptidase M24  56.46 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  57.78 
 
 
402 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  54.81 
 
 
405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  51.24 
 
 
399 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  50 
 
 
400 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  49.75 
 
 
400 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  46.9 
 
 
380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  43.26 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  44.99 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  44.85 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  47.7 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  45.41 
 
 
377 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  45.97 
 
 
414 aa  330  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  40.1 
 
 
435 aa  319  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  42.82 
 
 
419 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  41.78 
 
 
448 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  35.91 
 
 
371 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  32.13 
 
 
365 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  32.13 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  32.13 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  32.13 
 
 
365 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  32.13 
 
 
365 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  32.13 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  31.86 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  31.86 
 
 
365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  34.44 
 
 
373 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  31.58 
 
 
365 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  31.58 
 
 
365 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  32.14 
 
 
365 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  30.22 
 
 
362 aa  179  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  33.8 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  35.75 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  32.88 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  35.75 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  37.32 
 
 
386 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  32.5 
 
 
367 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  29.2 
 
 
364 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  36.75 
 
 
369 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  36.23 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  30.14 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  30.16 
 
 
365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  33.98 
 
 
367 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  34.45 
 
 
378 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  35.1 
 
 
384 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  34.4 
 
 
383 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.97 
 
 
376 aa  160  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  35.03 
 
 
376 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  28.89 
 
 
357 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  32.88 
 
 
366 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  29.23 
 
 
369 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  35.61 
 
 
382 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  27.88 
 
 
353 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  29.67 
 
 
351 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  27.88 
 
 
353 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  29.67 
 
 
351 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  33.15 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  35.33 
 
 
361 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  34.26 
 
 
371 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  28.06 
 
 
361 aa  152  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  30.68 
 
 
368 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  33.43 
 
 
372 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  28.69 
 
 
354 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  30.06 
 
 
358 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  29.72 
 
 
358 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  30.39 
 
 
357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  33.52 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  32.15 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  30.46 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  32.29 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  36.07 
 
 
376 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  31.77 
 
 
358 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  34.73 
 
 
375 aa  143  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  32.56 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  28.22 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  28.14 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  34.18 
 
 
353 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  34.18 
 
 
353 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  34.6 
 
 
353 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  28.06 
 
 
361 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  30.32 
 
 
354 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  35.57 
 
 
348 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  34.03 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  34.03 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  34.03 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  34.03 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  34.18 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  34.03 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  35.25 
 
 
367 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>