22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55800 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55800  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  318  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4862  hypothetical protein  76.98 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0540679  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  33.77 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  36.64 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  36.64 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  45.26 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0639  peptidase A24A, prepilin type IV  34.27 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4589  peptidase A24A prepilin type IV  36.84 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  31.78 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  31.78 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4375  peptidase A24A, prepilin type IV  31.97 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  31.78 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  30.19 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  34.34 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  29.09 
 
 		 194 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  28.39 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  32.53 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4835  hypothetical protein  41.11 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  25.18 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  34.62 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  23.27 
 
 		 189 aa  40.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>