28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51730  TolA protein  100 
 
 		 347 aa  670    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000424658  decreased coverage  0.00000451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1276  TonB family protein  66.67 
 
 		 326 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274487  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  62.71 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  62.15 
 
 		 356 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  64.55 
 
 		 452 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  74.14 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  74.14 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  74.14 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  74.14 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4403  TonB-like  77.66 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4537  TolA protein  98.8 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  32.46 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  33.63 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  29.88 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  36.5 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  33.83 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  21.69 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  21.45 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  33.46 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  33.73 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  26.85 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  32.91 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  32.91 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  38.32 
 
 		 2196 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  33.33 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  40 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  28.02 
 
 		 2397 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  65.12 
 
 		 914 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>