More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  98.33 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  77.08 
 
 		 240 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  77.02 
 
 		 241 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  74.17 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  74.17 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  73.84 
 
 		 242 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  74.58 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  73 
 
 		 242 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  72.69 
 
 		 243 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  47.66 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  36.36 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  34.2 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  37.23 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  38.98 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  36.36 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  40.77 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  34.06 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  39.48 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  38.24 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  36.29 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  38.14 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  35.24 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  33.04 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  34.19 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  29.13 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  30.47 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  30.47 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  30.22 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  28.64 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  28.72 
 
 		 236 aa  89  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  38.85 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  28.16 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  27 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  29.49 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  29.89 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  29.66 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  31.61 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  30.27 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  31.03 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  28.11 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  33.15 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  28.71 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  25.36 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  30.87 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.83 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  32 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  31.74 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  38.06 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  38.06 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  28.77 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  29.1 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  36.23 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  30.56 
 
 		 511 aa  65.5  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  27.66 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  37.31 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  29.1 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  30.64 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.33 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  28.5 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  30.17 
 
 		 525 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.14 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  34.78 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  36.63 
 
 		 540 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  30.86 
 
 		 508 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  31.46 
 
 		 575 aa  62  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  28.11 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  30.53 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  34.62 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  34.55 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  25.67 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  33.04 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  31.06 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  34.82 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  33.96 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  27.08 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  30.39 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  34.26 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  29.79 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  35.9 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  33.54 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  27.57 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  29.19 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  29.71 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  37.61 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  35.29 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  34.68 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  31.39 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  38.89 
 
 		 528 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  27.67 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>