54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  373  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  89.47 
 
 
171 aa  286  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  46.91 
 
 
162 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  43.71 
 
 
170 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  44.44 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  46.45 
 
 
173 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  33.14 
 
 
244 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  33.14 
 
 
238 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  32.92 
 
 
230 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  34.43 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  35.51 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  35.88 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  25.62 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  33.83 
 
 
148 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  29.41 
 
 
161 aa  54.7  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  35.85 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  30.63 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  30.63 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  28.46 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  25.53 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  24.22 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  26.83 
 
 
158 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  25.53 
 
 
164 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  27.72 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  30.48 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  25.18 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  24.82 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  24.38 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  25.18 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  25.18 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  32.69 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  25.18 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  24.81 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  27.13 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  24.11 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  24.11 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  25.34 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  27.27 
 
 
143 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  27.83 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  31.3 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  30.39 
 
 
157 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  28.89 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  24.58 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  28.89 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  31.3 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  26.62 
 
 
180 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  25.58 
 
 
153 aa  41.2  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  27.87 
 
 
151 aa  40.8  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>