More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14421 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  100 
 
 
303 aa  613  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  81.19 
 
 
303 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  81.19 
 
 
303 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  81.19 
 
 
303 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  58.94 
 
 
313 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  54.93 
 
 
343 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  58.61 
 
 
313 aa  338  9e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  55 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  55.96 
 
 
319 aa  331  9e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  53.97 
 
 
314 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  52.16 
 
 
314 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  52.16 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  53.51 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  52.32 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  51 
 
 
310 aa  299  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  50.33 
 
 
318 aa  298  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  51.96 
 
 
315 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  54.33 
 
 
318 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  47 
 
 
293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  47.04 
 
 
301 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  46.31 
 
 
303 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 
302 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
301 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
301 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 
301 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
301 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
301 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
301 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
301 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
301 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
301 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  45.82 
 
 
301 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
301 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 
302 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 
302 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 
294 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 
299 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 
299 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 
308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  45.07 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 
303 aa  250  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 
299 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 
298 aa  247  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 
307 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 
299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 
301 aa  245  6e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  45.27 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 
299 aa  243  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 
315 aa  243  3e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 
301 aa  242  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 
300 aa  242  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  42 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  47.57 
 
 
300 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 
300 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 
301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  43.67 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
489 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 
297 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 
451 aa  235  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  41.06 
 
 
303 aa  235  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 
297 aa  235  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  44.85 
 
 
300 aa  235  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  45.27 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 
296 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 
296 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 
306 aa  229  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  42.33 
 
 
305 aa  229  6e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 
301 aa  228  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 
468 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  41.06 
 
 
296 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  38.67 
 
 
312 aa  223  4e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
297 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  38.05 
 
 
303 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  38.33 
 
 
315 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 
307 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 
322 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  38 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  38.93 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 
304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 
298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 
299 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 
310 aa  212  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 
299 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 
298 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  41.18 
 
 
324 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 
293 aa  209  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  37.42 
 
 
302 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 
300 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 
313 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 
303 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  37.95 
 
 
314 aa  209  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>