76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04811 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  73.1 
 
 		 171 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  64.12 
 
 		 170 aa  231  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  64.12 
 
 		 170 aa  231  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  56.71 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  56.63 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  56.33 
 
 		 170 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  56.96 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  56.25 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  55.7 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  36.16 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  36.16 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  38.27 
 
 		 180 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  36.16 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  35.15 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.13 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  37.93 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  34.62 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.18 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.76 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.54 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  26.58 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  26.19 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.12 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  30.69 
 
 		 448 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  29.85 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.47 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25.45 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  26.25 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  30.23 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  28.14 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.41 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  25.9 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  23.6 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.63 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  27.98 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  25.66 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  26.71 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  34.96 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  29.08 
 
 		 184 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 		 156 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  28.28 
 
 		 181 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 		 156 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  26.09 
 
 		 156 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  27.61 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  26.22 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.52 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>