More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3321 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3321  ABC transporter related  100 
 
 		 491 aa  966    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510462 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.31 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.94 
 
 		 492 aa  385  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.96 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  39.92 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.49 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.49 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.77 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  46.35 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.49 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.14 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.24 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.93 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  41.44 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  46.15 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.55 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  46.15 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  44.49 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  46.18 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.76 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  45.03 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.38 
 
 		 512 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.51 
 
 		 516 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44.56 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43.67 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.42 
 
 		 508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  42.59 
 
 		 503 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  43.38 
 
 		 511 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.93 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  46.48 
 
 		 519 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.91 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  45.73 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  45.73 
 
 		 517 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  43.58 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  41.13 
 
 		 512 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.19 
 
 		 527 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.4 
 
 		 524 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.82 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.4 
 
 		 524 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.4 
 
 		 524 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  46.08 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.44 
 
 		 515 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.11 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.49 
 
 		 514 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.61 
 
 		 524 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.49 
 
 		 514 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.55 
 
 		 496 aa  359  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.29 
 
 		 514 aa  359  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 494 aa  358  9e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.4 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.98 
 
 		 504 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.5 
 
 		 521 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.17 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.29 
 
 		 514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.98 
 
 		 504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  42.45 
 
 		 516 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 507 aa  357  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  42.08 
 
 		 505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  42.65 
 
 		 507 aa  356  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  42.12 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.82 
 
 		 499 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.74 
 
 		 506 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.97 
 
 		 512 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.97 
 
 		 512 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  46.08 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  38.27 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  46.29 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 505 aa  355  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.18 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  45.02 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  39.31 
 
 		 496 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  42.17 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.65 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.07 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  45.93 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  37.55 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  45.07 
 
 		 521 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.23 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 		 494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  42.04 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.69 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  43.76 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.88 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40.88 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  46.42 
 
 		 524 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  40.28 
 
 		 511 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 496 aa  352  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>