197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0963 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0963  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  848    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2121  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2008  putative transmembrane permease  48.09 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0141901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  44.96 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0071  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.155501  hitchhiker  0.000000000000465333 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  37.62 
 
 		 427 aa  269  8e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0515  hypothetical protein  34.43 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  32.84 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  28.68 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 517 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  25.96 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  25.87 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  25.87 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  25.87 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  25.87 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  25.87 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  26 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  25.87 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  25.87 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  25.87 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  28.25 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  28.16 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  25.87 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  25.24 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  26.36 
 
 		 433 aa  103  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  25.84 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  26.87 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  26.09 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  26.87 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  26.87 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  26.97 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  26.87 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  26.87 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  25.23 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  25.91 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  26.98 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  26.98 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  26.98 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 452 aa  99.8  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  26.82 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 465 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 463 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 471 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  26.82 
 
 		 489 aa  97.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  26.07 
 
 		 492 aa  96.3  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  27.08 
 
 		 466 aa  96.3  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 475 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  25.53 
 
 		 461 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 465 aa  93.6  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  26.37 
 
 		 489 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  26.72 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  25.73 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  26.7 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  26.93 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  24.76 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  24.76 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  24.76 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  24.76 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  24.76 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 478 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>